本院動物室位於地下二樓，整體空間約 53.8坪，除提供動物飼育之空間外，動物室亦配備有各類動物生理實驗儀器，以利研究之進行。內部功能區計有 一般飼養飼育室2間、 獨立飼養飼育室、電生理實驗操作室、動物行為實驗操作室、多功能檢疫房2間、洗滌室及辦公室。目前動物室僅可提供鼠類實驗動物之飼育空間，一般飼養飼育室可飼養環境潔淨度要求不高之實驗動物，獨立飼養飼育室之動物飼育系統可分別供應各飼育盒已通過 0.22um 濾網之乾淨空氣，以及其獨立排氣之特點，故可飼養環境潔淨要求較高之實驗動物，包括先天性免疫不全之鼠類動物。目前動物室有二間實驗操作室，可進行各類活體動物試驗。目前動物室有專責工作人員 2 人，負責實驗動物飼養管理、代為操作貴重動物生理實驗儀器及教育實驗人員使用一般動物生理實驗之儀器。