第一級

意外發生於實驗室防護設備內（例如在操作實驗時，具高感染性檢體翻灑於生物安全櫃中），不致對人員生命造成立即性危害。

應向實驗室主管報告並書面記錄。

依設置單位之實驗室生物安全緊急應變計畫內容（生物安全意外事件處理程序）處理。

第二級

意外發生於實驗室防護設備外之其他區域（例如拿取高感染性檢體，不慎掉落實驗室地板，造成濺灑），對人員生命及實驗室內部環境有危害及污染之虞。

應向實驗室主管報告並書面記錄。如有人員感染或傳染之虞，設置單位應向中央主管機關報告。

依設置單位之實驗室生物安全緊急應變計畫內容（生物安全意外事件處理程序）處理。
必要時，可請求相關主管機關協助。

第三級

意外發生且已擴散到實驗室以外區域（例如強震造成生物安全第三等級實驗室負壓失效，且感染性生物材料翻灑於實驗室地板），對人員生命及實驗室週遭社區民眾及環境有嚴重危害及污染之虞。

應向實驗室主管報告並書面記錄。設置單位應立即向中央主管機關報告。

依設置單位之實驗室生物安全緊急應變計畫內容（生物安全意外事件處理程序）處理。
必要時，中央主管機關得統籌指揮相關主管機關配合處理。